İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi Anayasa Mahkemesi kararını hiçe saydı. Yüksek Mahkemenin anaysa'ya aykırı bulduğu Ceza kanundaki "Tutukluluk süresi iki katı artırılır" maddesini iptal etmişti. Karara göre tutukluluk süresi en fazla 5 yılla sınırlandırılmıştı. Ancak Ergenekon Mahkemesi Anayasa Mahkemesi'nin bu içtihadı uygulamadı
